Drugi građanski rat u Engleskoj bio je još nemilosrdniji od prvog. Cromwell je izjavio da je razlog rata "popustljivost" prema protivnicima nakon pobjede. Pobjeda u prvom ratu pokazuje da Bog podržava puritance. Dakle, ovo je pobuna protiv Boga. Vojnicima je naređeno da se "osvete".
Engleska kuga
Nakon eliminacije grofa od Stafforda i nadbiskupa Canterburyja, Charles je izgubio svoje najjače pouzdanike. Parlament je nastavio ofenzivu. Tražio je reformu crkve, ukidanje episkopije, pravo imenovanja i smjene ministara, kontrolu svih postupaka monarha. Karl je odbacio ove zahtjeve: "Kad bih pristao na ovo, postao bih samo duh, prazna kraljeva sjena." U studenom 1641. Parlament je usvojio Great Remontstration, zbirku članaka u kojima su navedeni zločini krune. U vezi s ustankom u Irskoj, Engleska je odlučila oformiti vojsku. Međutim, parlament je odbio smatrati kralja vrhovnim zapovjednikom.
Kralj se više nije mogao povući. Saznao je da njegov položaj prije nije bio tako beznadan kao što se vjerovalo. Ima pristaše u samom parlamentu, županijama i narodu. Saznao sam da ga varaju igrajući "rat" sa Škotskom. Karlo I. je pobjesnio i u siječnju 1642. naredio je uhićenje pet glavnih urotnika. Međutim, "ptice su odletjele", kako je primijetio sam monarh. Kao odgovor, oporba je iz parlamenta izbacila sve kraljeve pristaše, pobunila građane na pobunu. Kralj je odlučio napustiti pobunjeni London, otišao u Oxford i najavio okupljanje svojih pristaša. Parlament je počeo formirati policijske jedinice.
Izbio je trom građanski rat. Tri godine se odužila bez mnogo rezultata. Bilo je više pristaša parlamenta, ali oni su bili slabo organizirani i disciplinirani. "Kavaliri" (plemići rojalisti) bili su discipliniraniji i imali su vojno iskustvo. Kraljevim trupama zapovijedao je Karlov nećak, mladi princ Rupert, koji je imao iskustvo rata sa Španjolcima na strani nizozemskih pobunjenika i Tridesetogodišnjeg rata. Kraljevska konjica lako je pobijedila "okrugle glave" (naziv je došao po kratkoj kosi), parlamentarne milicionere. No, kavaliri su djelovali bez posebnog plana, strategije i nisu iskoristili svoje prve pobjede. Bogatstvo Londona i velikih britanskih luka, resursi buržoazije isprva su uravnotežili sposobnosti gospode.
Cromwell i nova vojska
U međuvremenu se i sama oporba podijelila. Umjereni prezbiterijanci vladali su parlamentom. Ali radikalnije skupine također su ojačale. Nezavisni ("nezavisni") protivili su se bilo kojoj crkvenoj hijerarhiji (moći sinoda prezbitera) i kraljevskoj vlasti općenito. Tražili su autonomiju mjesnih crkvenih zajednica. Predložili su zamjenu monarhije republikom. Nivelatori („izjednačivači“) otišli su još dalje. Rekli su da moć uopće nije potrebna, svaka zajednica može živjeti sama po "božanskim pravilima". Bilo je i anabaptista, braonista, kvekera, koji su se smatrali samo "spašenima", a ostatak svijeta zaglibio je u grijehu i poginuo.
U tim vjerskim prepirkama, koje su tada imale vodeći politički značaj, do izražaja je došao Oliver Cromwell. Dolazio je iz građanske puritanske obitelji, izabran je za člana parlamenta i postao ideološki protivnik kraljevske vlasti. Tijekom previranja regrutirao je i opremio konjički odred od nekoliko desetaka ljudi. Godine 1643. pod njegovim je vodstvom već bilo 2 tisuće ljudi. Dobili su nadimak "željezni". Njegov je puk postao poseban, ideološki. Cromwell je privukao radikalne sektaše: nezavisne, izravnjače, baptiste. Cromwell je uveo instituciju propagandističkih propovjednika (tadašnjih političkih komesara). Slijedili su disciplinu i inspirirali borce. Njegovi vojnici nisu pili alkohol niti se kockali. Zbog lošeg ponašanja bili su strogo kažnjeni. Disciplina je bila željezna. Istodobno, ideološki puk borio se krajnje brutalno. Ironsides je razbio hramove Anglikanske crkve, mučio svećenike, nije štedio rojaliste i papiste (katolike). Bliski odred počeo je dobivati bitke. Primijetili su ga i počeli ga aktivno hvaliti. Cromwell je postao heroj revolucije.
Neovisni su u borbi protiv prezbiterijanaca odlučili staviti ulog na Cromwella. Njegovi uspjesi bili su napuhani, pretjerani, neuspjesi su prešućivani ili su za njih bili krivi prezbiterijanski zapovjednici. Cromwella su nazivali "spasiteljem". Zapovjednik je u to vjerovao, počeo se smatrati "izabranim" za spas zemlje. Pokazao se kao izvrstan političar - neprincipijelan i ciničan. Zajedno s Independentima, Cromwell je uspio postići demokratizaciju vojske. Prema zakonu o samoodricanju, svi su saborski zastupnici dali ostavku na zapovjedništvo. Vršnjaci su izgubili tradicionalno pravo zapovijedati vojskom. Thomas Fairfax postao je vrhovni zapovjednik, Cromwell je dobio drugo mjesto u vojsci, mjesto načelnika cijele konjice. Fairfax i Cromwell počeli su stvarati "novu uzornu vojsku" po uzoru na one sa željeznom stranom. Vojsku je činilo preko 20 tisuća vojnika, ukupno 23 pukovnije (12 pješačkih, 10 konjaničkih i 1 dragunski). Trupe su usađene u strogu disciplinu i ideologiju (vjerski radikalizam).
Poraz kralja
U ratu je došlo do prekretnice. Mnogobrojnije i sada dobro organizirane okrugle glave počele su tući gospodu. U odlučujućoj bitci kod Nasebyja 14. lipnja 1645. 13 -tisućna vojska parlamenta pod zapovjedništvom Fairfaxa i Cromwella porazila je 7 tisuća rojalista Karla i Ruperta. Kraljevska vojska prestala je postojati: 2 tisuće je ubijeno, 5 tisuća zarobljeno. Kralj je uspio pobjeći Škotima, ali je zaplijenjena njegova arhiva gdje su postojali dokumenti o vezama s katolicima, Ircima i Francuskom. Karlovu tajnu prepisku parlament je izrazio kao dokaz kraljeve dvoličnosti i izdaje.
Škoti su neko vrijeme držali kralja u položaju zarobljenika, istiskivali su mu ustupke. U siječnju 1647. Charles je prodan britanskom parlamentu za 400.000 funti. Uhapšen je i nije znao što će s kraljem. Prezbiterijanci su vjerovali da se Karla treba vratiti na prijestolje, ali njegovu moć treba ograničiti. S kraljem su se vodili pregovori. U njima je sudjelovao i Cromwell. Zastupnici su se bojali da će kralj prekršiti obećanja, zaglibili su se u sporovima i došli do novih jamstava. U međuvremenu su radikalni osjećaji rasli i jačali. Neovisni su odbili vratiti Karlovu krunu i nazvali prezbiterijance "novim tiranima". Ponudili su stvaranje republike. "Izjednačivači" su općenito zagovarali univerzalnu slobodu i demokraciju. Drugi su sektaši zemlju vukli prema potpunoj anarhiji.
Istodobno se pojavila prijetnja diktature. Vojska je postala nova politička snaga. Cromwell je osnovao "Vijeće opće vojske", koje je postalo novo političko središte, konkurent parlamentu. Cromwell je potisnuo Fairfax u drugi plan i postao de facto vrhovni zapovjednik. Parlament se pokušao suprotstaviti novoj prijetnji. Uhićeno je nekoliko vođa Neovisnih i Levellera. Odlučili su poslati vojsku dalje - kako bi umirili Irsku, te rasformirali preostale pukovnije. Kažu da je rat završio, nema novca. Ali bilo je prekasno. Cromwell je spriječio demobilizaciju putem svojih propovjedničkih komesara. Pukovnije nisu bile raspuštene, odbile su se razoružati i nisu otišle u Irsku. Vijeće sve vojske započelo je borbu za vlast i objavilo političke dokumente. Obećao je zaštititi "slobodu".
Drugi građanski rat
U međuvremenu je stanje u zemlji bilo žalosno. Nevolje su odnijele desetke tisuća života. Županije i gradovi bili su devastirani, poduzeća su prestala, poljoprivreda je pretrpjela velike gubitke. Cijene su brzo rasle, ljudi su gladovali. Dobitnici su žurili da se nagrade. Oduzeti su oduzeti posjedi kralja, rojalista i crkve. U grabežljivosti prezbiterijanci i nezavisni nisu bili inferiorni jedni prema drugima. Ljudi su se opet pobunili. U Londonu su građani uzvikivali zastupnicima da je pod kraljem život bolji. Karl je opet imao pristaše.
Karl je odlučio da ima priliku promijeniti sve u svoju korist. Uz pomoć časnika koji su mu bili naklonjeni, u studenom 1647. pobjegao je na otok Wight. Kralja je uzdržavala flota. U Škotskoj su prezbiterijanci odlučili podržati kraljevsku vlast kako zemlja ne bi skliznula u potpuni kaos. U prosincu 1647. kralj je sklopio sporazum sa škotskim predstavnicima: obvezao se priznati prezbiterijansku crkvu u zamjenu za vojnu pomoć. Karl je također počeo pregovarati s Ircima. Rojalističke pobune zahvatile su cijelu Englesku.
U "vojsci novog modela" počeli su nemiri. Namijenili su je nivelatori. Pobunu su podigle četiri pukovnije, zahtijevajući izjednačavanje svih građana u pravima, preraspodjelu zemljišta. Cromwell je uspio ugušiti pobunu zahvaljujući svom ogromnom autoritetu. Osobno je stigao u trupe i privukao vojne propovjednike. Borba je izbjegnuta. Police su bile "očišćene", vođe pogubljeni, aktivisti za izravnavanje otpušteni ili uhićeni. Disciplina u vojsci je vraćena. Vojska je bačena protiv rojalista i Škota. Drugi građanski rat bio je još nemilosrdniji od prvog. Cromwell je izjavio da je razlog rata "popustljivost" prema protivnicima nakon pobjede. Krivnja kralja i njegovih pristaša sada je mnogo veća. Pobjeda u prvom ratu pokazuje da Bog podržava puritance. Dakle, ovo je pobuna protiv Boga. Vojnicima je naređeno da se "osvete". To je dovelo do brutalnih pogroma gradova i mjesta, spaljenih farmi i masovnih pogubljenja.
Pobunjenici nisu mogli odoljeti dobro organiziranoj i kohezivnoj vojsci. Većina ustanka bila je spontana. Na nekim mjestima pobunu su podigli rojalisti, na drugim prezbiterijanci, koji su pokušali zaštititi parlament od Cromwella, na trećim - samo izgladnjeli seljaci i mještani. Raštrkani i spontani ustanci brzo su se utopili u krvi. Zatim je Cromwell prešao na Škote. U kolovozu 1648., u bitci za Preston, 8 hilj. Cromwellova vojska slomila je 20 tisuća. kombinirana vojska Škota i rojalista. Škotska je tražila mir.
Diktatura
Nakon toga, Cromwell je slomio parlament. Vojska je naredila "čišćenje" prezbiterijanaca iz parlamenta. Donji dom bio je prestravljen. Odlučio sam pozvati kralja, pomiriti se s njim. Karl je pristao na pomirenje, došao je u London. No moć je već bila na strani Cromwella. Lako je odbacio svaki privid legitimnosti. U prosincu su njegove pukovnije ušle u London, privele Karla. Kapetan Pride provalio je u Donji dom, uhitio ili protjerao 150 zastupnika. Ostali su zastupnici sami pobjegli. Od parlamenta je ostalo 50-60 ljudi, spremnih glasati onako kako Cromwellu treba. Ovaj ostatak dobio je nadimak "krpa".
Cromwell je izvršio veliku "čistku" i u Londonu. Pobunjenici, simpatični prema kralju i prezbiterijancima, protjerani su iz grada. Mnogi su ostali bez krova nad glavom, imovina, sredstva za život, nestali. Ostaci parlamenta, prema uputi Cromwella, odlučili su u siječnju 1649. suditi kralju. Rješenje bez presedana u to doba. Dom lordova odbio je prihvatiti ovu odluku. Dom lordova je raspušten. Kraljev slučaj nije prihvatio nijedan sud. Osnovan je Vrhovni sud vojnih "svetaca". Sud je Charlesa proglasio krivim kao tiranina, izdajicu i neprijatelja otadžbine i osudio ga na smrt. 30. siječnja 1649. Charles je odrubljen glava u Whitehallu. U veljači je ukinuta monarhija, uspostavljena republika i stvoreno Državno vijeće. Formalno, najveća moć u zemlji pripadala je parlamentu, ali je "krnja" bila potpuno podređena novom diktatoru. Kao rezultat toga, Cromwell je uspostavio osobnu diktaturu - protektorat.
