Rusko-japanski rat postao je prvi vojni sukob u svjetskoj povijesti u kojem su sudjelovale podmornice, nova vrsta ratnih brodova. Pojedinačni slučajevi i pokušaji korištenja podmornica u vojne svrhe zabilježeni su ranije, no tek krajem 19. stoljeća razvoj znanosti i tehnologije omogućio je razvoj punopravne podmornice. Do 1900. godine nijedna pomorska flota na svijetu još nije bila naoružana borbenim podmornicama. Glavne svjetske sile započele su svoju izgradnju gotovo istodobno 1900.-1903.
Početkom 20. stoljeća na podmornice se konačno počelo gledati kao na oružje koje je omogućilo obranu na moru čak i od jačeg neprijatelja. Razvoj podmorničke flote ovih je godina djelomično olakšala činjenica da su ih pomorski zapovjednici s početka prošlog stoljeća gledali kao svojevrsne razarače, vjerujući da bi u budućnosti podmornice mogle zamijeniti umiruću klasu površinskih razarača. Cijela je stvar bila u tome da su širenje i razvoj suvremenog brzometnog topništva i reflektora, koji su bili ugrađeni na ratne brodove, značajno smanjili mogućnost korištenja razarača - njihova su djelovanja, uglavnom, sada bila ograničena samo na noćne sate. Istodobno, podmornice su mogle djelovati i noću i danju. I premda su novi podmornički ratni brodovi još uvijek bili daleko od savršenog, njihov razvoj obećavao je zemljama ogromne taktičke prednosti.
Gotovo od trenutka kada su razarači napali japansku flotu 27. siječnja (9. veljače) 1904. godine na rusku eskadrilu u Port Arthuru, ruska tvrđava bila je podvrgnuta prilično gustoj pomorskoj blokadi. Učinkovitost uobičajenih načina prevladavanja ove opsade natjerala je časnike da traže nestandardna rješenja. Glavnu ulogu u ovom procesu, kao i uvijek, imali su entuzijasti koji su zapovjedništvu flote predlagali vlastite projekte u raznim granama vojne opreme: obrambenim granama, izvornim minskim kočama i, konačno, podmornicama.
Zastupnik Naletov (1869-1938), koji je u budućnosti postao poznati brodograditelj, uz podršku viših časnika flote, bio je angažiran na izgradnji podmornice-minopolagača prema vlastitom nacrtu, radovi su bili u cijelosti ljuljati se u radionicama tvornice Nevsky koja se nalazi na poluotoku Tigrovy Tail, prethodno su ovdje bili sastavljeni razarači … Tajno, u potopljenom položaju, čamac je trebao ući u vanjsku raketu i postaviti minska polja na ruti japanske eskadrile. Ideja o izgradnji podvodnog minobacača došla je u Naletov na dan pogibije ruskog bojnog broda "Petropavlovsk", no podmornicu je počeo graditi tek u svibnju 1904. godine.
Nakon što je završio s izgradnjom trupa broda (bio je to čelični zakovani cilindar sa stožastim krajevima s istisninom od 25 tona), zastupnik Naletov je prekinuo rad na tome - u Port Arthuru nije bilo odgovarajućeg motora. Vjednik B. A. Vilkitsky, imenovan zapovjednikom nedovršenog čamca (kasnije polarni istraživač, 1913.-14. Otkrio je i opisao arhipelag Severnaya Zemlya), izgubivši vjeru u uspjeh ovog projekta, ubrzo je odustao od zapovijedanja brodom. Daljnja sudbina ovog neobičnog projekta ostaje nepoznata: prema jednom izvoru, M. P. Napadi, neposredno prije predaje tvrđave, naredili su rastavljanje unutrašnje opreme čamca, a trup podmornice je dignut u zrak, prema drugim izvorima, podmornica je poginula dok je bila u suhom doku Port Arthura tijekom drugog granatiranja Japanaca topništvo. Kasnije je Naletov uspio realizirati svoju zamisao o podvodnom minobacaču u podmornici "Crab", koja je postala dio ruske flote 1915. godine i uspjela je aktivno sudjelovati u Prvom svjetskom ratu na Crnom moru.
Drugi projekt podmornice, koji je predložen u Port Arthuru, bio je povezan s pokušajem modernizacije stare podmornice Dzevetsky, koja je rutinski bila u službi s morskim tvrđavama Rusije od kraja 19. stoljeća. Podmornica je pronađena u ožujku 1904. u jednom od skladišta tvrđave, a pronašao ju je potpukovnik A. P. Meller, koji je s admiralom Makarovom stigao u tvrđavu kako bi pomogao u popravku oštećenih brodova. Ova je podmornica čak i u to vrijeme bila prilično arhaična. Imala je pedalni pogon, čamac nije imao periskop, kao ni minsko oružje. Međutim, utvrđeno je da su trup broda, upravljački mehanizmi i polupotopljena stabilnost zadovoljavajući. Potpukovnik Meller pokazao je interes za podmornicu i odlučio poduzeti njezinu obnovu. Istodobno, zbog velike zaposlenosti u vezi s popravkom ratnih brodova ruske eskadrile, Meller nije mogao posvetiti dovoljno vremena radu s brodom. Iz tog razloga radovi na modernizaciji podmornice trajali su do 28. srpnja (10. kolovoza) 1904. godine. Sve dok Meller, nakon što je eskadrila otišla na proboj u Vladivostok, nije napustio opkoljenu tvrđavu (na razaraču "Odlučan" kroz Chifu).
Odlaskom iz Port Arthura Mellera, popravak podmornice prestao je na dva mjeseca, radovi su nastavljeni tek u listopadu 1904., kada je mlađi strojarski inženjer bojnog broda Peresvet P. N. Tikhobaev odlučio na podmornicu ugraditi benzinski motor. Kontraadmiral Loshchinsky, kako bi Tikhobaevu pomogao u radu, imenovao je zapovjednika BP Dudorova zapovjednikom podmornice. Na zahtjev potonjeg, zapovjednik ruske eskadrile, RN Viren, dao je motor sa svog broda za ponovno opremanje podmornice. Trup podmornice bio je podijeljen u dva odjeljka pod tlakom: prednji upravljački odjeljak u kojem su bili vozač i zapovjednik broda te stražnji odjeljak, motorni prostor. Na bokovima podmornice montirana su dva rešetkasta minska (torpedna) uređaja s brodova bojnih brodova "Peresvet" i "Pobeda", a izrađen je i domaći periskop. Brod je izgrađen u gradu Minnoe na Tigrovom repu: ovdje su bile radionice, štoviše, ovo je mjesto vrlo rijetko bilo izloženo japanskom granatiranju.
Početkom studenog 1904. u Zapadnom bazenu održana su prva pokusa podmornice na moru, koja su, međutim, završila neuspješno: ispušni plinovi prodrli su u kontrolni odjeljak broda, zbog čega su Dudorov i strojovođa izgubili svijest, a sama podmornica potonula je na plitkoj dubini. No, zahvaljujući raspoloženju Tikhobaeva, koji je pratio podmornicu na brodu (on sam, zbog svoje punoće i visokog stasa, nije mogao stati u čamac), podmornica je spašena zajedno s posadom. Kako bi spriječio ulazak ispušnih plinova iz motora koji radi u upravljački odjeljak, P. N. Tikhobaev izumio je dizajn posebne pumpe. U isto vrijeme, nakon okupacije planine Vysokaya 22. studenog (5. prosinca), Japanci su započeli svakodnevno granatiranje unutarnjih luka ruske tvrđave. Iz tog razloga odlučeno je da se podmornica prebaci na vanjsku rajdu, gdje su, ispod Zlatne planine, u uvali, koju su formirala dva japanska vatrogasna broda zalijepljena za obalu, nastavljeni radovi na modernizaciji čamca.
Istodobno su na jednom od vatrogasnih brodova opremljeni stambeni prostori i radionica. Kad je more bilo uzburkano, podmornica na dizalicama podignuta je na vatrogasni brod. Svi su radovi završeni do večeri 19. prosinca 1904. (1. siječnja 1905.). Sljedećeg dana planirano je provođenje novih ispitivanja podmornice. No, u noći 20. prosinca (2. siječnja), Port Arthur je predan Japancima. Ujutro tog dana, po nalogu kontraadmirala Loshchinskog, Dudorov je podmornicu doveo do dubine i potopio je u vanjsku ratvu tvrđave. Glavne taktičke i tehničke karakteristike ovog broda Port Arthur ostale su nejasne do danas. Budući da je podmornica bila opremljena benzinskim motorom, radilo se, zapravo, o polupodmornici (poput čamca "Keta" poručnika S. A. Yanovića), ili neposredno prije napada "zaronila" nekoliko minuta pod vodu.
Međutim, bez ispunjenja svoje izravne svrhe, ove podmornice Port Arthur odigrale su ulogu u psihološkom ratu protiv Japanaca. Tisak u Rusiji nekoliko je puta objavio ono što bi se danas nazvalo "patke" o prisutnosti ruskih podmornica u Port Arthuru. Istodobno, Japanci su pretpostavili prisutnost ruskih podmornica u tvrđavi. Na izgledu potonulih ruskih brodova koje su Japanci sastavili nakon predaje Port Arthura označena je podmornica ili ono što su Japanci tada uzeli za nju. S tadašnjim primitivizmom dizajna brodova, njihovim vrlo malim pomakom i morbidnom maštom za ostatke trupa podmornice, moglo bi se uzeti cisterna ili neki dijelovi lučkih objekata.
Valja napomenuti da je početkom 20. stoljeća velika većina časnika ruske mornarice smatrala nepotrebnim dodavati podmornice u njezin sastav i trošiti novac na njihovu izgradnju. Neki su časnici izrazili mišljenje da podmornica neće vidjeti ništa ili vrlo malo pod vodom, pa će morati pipajući napasti neprijateljske brodove, oslobađajući torpeda na brodu naslijepo, nemajući šanse pogoditi cilj. Drugi časnici, koji su navikli na udobnost kabina površinskih ratnih brodova, rekli su da podmornice nisu ratni brodovi, već samo uređaji, duhoviti instrumenti za ronjenje i prototipovi budućih razarača podmornica.
Samo je nekoliko mornaričkih časnika čak i tada razumjelo izglede i moć novog mornaričkog oružja. Tako je Wilhelm Karlovich Vitgeft visoko cijenio novonastalo podvodno oružje. Davne 1889. godine, kao kapetan 2. ranga, otišao je na dugo putovanje u inozemstvo kako bi proučio minsko oružje i podmorničku flotu. Godine 1900. kontraadmiral Wittgeft obratio se dopisniku zapovjedniku pomorskih snaga na Pacifiku. U bilješci je napisao: „Pitanje podmornica u ovom je trenutku toliko napredovalo, do najkraćeg rješenja, da je počelo privlačiti pozornost svih flota svijeta. Još uvijek ne pružajući dovoljno zadovoljavajuće rješenje u borbenim uvjetima, podmornice se, međutim, već smatraju oružjem koje je u stanju proizvesti snažan moralni utjecaj na neprijatelja, budući da je svjestan da se takvo oružje može upotrijebiti protiv njega. Ruska flota je po tom pitanju išla ispred ostalih svjetskih flota i, nažalost, iz različitih razloga, prestala nakon završetka prvih manje -više uspješnih pokusa i pokusa na ovom području."
Kao eksperiment, kontraadmiral je zatražio ugradnju torpednih cijevi na stare podmornice Dzevetsky iz 1881. godine, koje imaju pogon na pedale, te zatražio slanje brodova na Daleki istok. U isto vrijeme ponudio je isporuku na parobrod Dobrovoljne flote uz obvezni posjet japanskim lukama, tako da su Japanci jamčili da će podmornice primijetiti. Kao rezultat toga, parobrod "Dagmar" isporučio je "paket" u tvrđavu, a izračun kontraadmirala se opravdao. Kad su u travnju 1904. minirane japanske bojne brodove Hatsuse i Yashima minirane u blizini Port Arthura, Japanci su vjerovali da su ih napale ruske podmornice, dok je cijela japanska eskadrila silovito i dugo pucala u vodu. Japanci su bili svjesni prisutnosti ruskih podmornica u Port Arthuru. Glasine o njima objavljene su u tisku. Vjeran svojoj zamisli o moralnom značaju novog podvodnog oružja, Wilhelm Witgeft naredio je dati radiogram kada su japanski bojni brodovi detonirani na minama na čemu admiral zahvaljuje podmornicama na uspješnom djelu. Japanci su uspješno presreli ovu radio poruku i "uzeli podatke u obzir".
U određenoj mjeri japansko je zapovjedništvo imalo sve razloge za strah od akcija ruskih podmornica. Još prije početka vojnog sukoba sa zemljom izlazećeg sunca, zapovjedništvo ruske flote pokušalo je stvoriti vlastite podmorničke snage u tvrđavi Port Arthur. Osim već spomenute podmornice Drzewiecki, u tvrđavu je isporučen čamac francuskog dizajnera T. Gubea, vjerojatno davne 1903. godine, dovezen je na bojni brod "Tsesarevich". Deplasman broda bio je 10 tona, posada je bila 3 osobe. Mogla je održavati brzinu od 5 čvorova 6-7 sati, naoružanje broda bilo je 2 torpeda. Već u prvim danima rata, zajedno s posebnim ešalonom, NN Kuteinikov, šef radnog odreda Baltičke tvornice, poslan je na Daleki istok. Bio je graditelj podmornice "Petr Koshka", a najvjerojatnije se i ova podmornica kretala željeznicom prema ruskom Dalekom istoku, među ostalim teretima. Tih godina imao je vrlo važnu prednost - mogao se rastaviti na 9 dijelova, nakon čega se mogao lako transportirati običnim željezničkim vagonima.
Ruski su mornari razmišljali i o mogućoj upotrebi podmornica od strane neprijatelja. Tako je admiral S. O. Makarov, koji je bio jedan od pokretača uporabe torpednog oružja, imao izvrsnu predodžbu o stupnju podvodne prijetnje ratnim brodovima. Već 28. veljače 1904. po zapovijedi je zahtijevao od svakog ratnog broda da nacrta siluete podmornica na površini, pozicijski položaj, a također i pod periskopom. Osim toga, određeni su i signalisti koji su trebali nadzirati more i identificirati podmornice. Brodovi su bili zaduženi za gađanje otkrivenih podmornica, a razarače i čamce za nabijanje podmornica.
Do kraja ljeta 1905. u Vladivostoku je sastavljeno 13 podmornica, ali kvalitete tih podmornica nisu zadovoljavale uvjete dalekoistočnog kazališta vojnih operacija, a zajednički im je nedostatak bio kratki domet krstarenja. Žurno izgrađeni i poslani na Daleki istok sa loše obučenim ili potpuno neobučenim timovima, korišteni su izuzetno slabo. Podmornice nije ujedinilo jedno vodstvo, a baze koje su im potrebne bile su odsutne. Osim loše opremljene baze u samom Vladivostoku, u ostalim dijelovima obale nije bilo dokova i točaka na kojima bi podmornice mogle napuniti zalihe. Veliki broj nedostataka i nedostataka, kao i raznih tehničkih problema, spriječio je podmorničare u obuci posade. U isto vrijeme, osoblje je mnogo vremena provodilo na popravcima i proizvodnim radovima. Sve je to, zajedno s nedostatkom organizacije borbene uporabe podmornica, svelo njihovo sudjelovanje u rusko-japanskom ratu na minimum, no podmorsku flotu u nastajanju čekala je velika budućnost.
